松原神社は明和9年（安永元年　1772）、佐賀藩第8代藩主鍋島治茂公により藩祖鍋島直茂公をお祀りする「日峯社」として創建されました。治茂公は佐賀藩中興の祖と仰がれ、六府方（殖産興業機関）や藩校弘道館の創設など藩政改革を積極的に進められましたが、その改革の初めにあたり、佐賀藩創業の精神に立ち返るべく、藩祖直茂公を祀る神社を創建されたのです。なお、ご神号「日峯大明神」は、直茂公のご戒名「高伝寺殿日峯宗智大居士」によるものです。
　その後、文化１４年（1817）に直茂公の夫人彦鶴姫様（陽泰院様）と祖父清久公（利叟様）を合祀し「松原社」と改称、更に明治5年（1872）、初代藩主勝茂公が合祀されました。
　明治6年（1873）、それまで春日（現在の佐賀市大和町）の敷山神社でお祀りされていた龍造寺隆信公、政家公、高房公の三柱を新に「北殿」として合祀、同年、幕末の名君十代藩主鍋島直正公の遺徳を偲ぶ旧藩士民の願いによりその御霊を祀る「南殿」が奉祀され、直茂公以下鍋島家4柱を祀る「中殿」とあわせ三つの本殿からなる「松原神社」となり、明治8年県社に列格、大正12年（1923）には最後の藩主、十一代直大公も南殿に合祀されました。
　昭和8年（1933）、松原神社西方の浄域に直正公の御霊をお遷しして新たに佐嘉神社が創建され、昭和23年（1948）には直大公の御霊も佐嘉神社に合祀されました。その後昭和38年（1963）、本殿を一殿二座に改築、鍋島家4柱を南座、龍造寺家3柱を北座に祀り現在に至っています。